Aventura continua pentru Neo, care acum poate sa faca lucruri ce par a sfida toate legile naturii si asta deoarece intr-adevar, totul este imaginar, creat de masini. In aceasta parte, Neo se lupta pentru supravietuirea oamenilor, mai ales ca ultima reduta a oamenilor, orasul Zion, aflat la mare adancime in pamant, urmeaza sa fie atacat de masini. Neo va afla si cine a creat matricea.
